广西巴马小型猪PAQR3基因克隆及表达谱分析
【目的】克隆广西巴马小型猪孕激素和脂联素分子受体3（PAQR3）基因,并研究该基因在广西巴马小型猪不同组织中的表达特性,为揭示PAQR3的功能及其在疾病模型中的作用打下基础。【方法】采用RT-PCR扩增广西巴马小型猪PAQR3基因,应用在线预测软件对其功能和结构进行生物信息学分析,并以q RT-PCR分析PAQR3基因在不同组织中的表达特性及高脂高糖诱导后的表达水平。【结果】广西巴马小型猪PAQR3基因编码区（CDS）序列全长936 bp,编码312个氨基酸,与人类（XM_006714106.2）、猕猴（NM_001257693.1）、牛（XM_010806259.1）、家犬（XM_01410...
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| Published in | 南方农业学报 Vol. 47; no. 8; pp. 1390 - 1395 |
|---|---|
| Main Author | |
| Format | Journal Article |
| Language | Chinese |
| Published |
广西大学动物科学技术学院,南宁,530005
2016
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| Subjects | |
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 2095-1191 |
| DOI | 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.08.1390 |
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| Abstract | 【目的】克隆广西巴马小型猪孕激素和脂联素分子受体3（PAQR3）基因,并研究该基因在广西巴马小型猪不同组织中的表达特性,为揭示PAQR3的功能及其在疾病模型中的作用打下基础。【方法】采用RT-PCR扩增广西巴马小型猪PAQR3基因,应用在线预测软件对其功能和结构进行生物信息学分析,并以q RT-PCR分析PAQR3基因在不同组织中的表达特性及高脂高糖诱导后的表达水平。【结果】广西巴马小型猪PAQR3基因编码区（CDS）序列全长936 bp,编码312个氨基酸,与人类（XM_006714106.2）、猕猴（NM_001257693.1）、牛（XM_010806259.1）、家犬（XM_014109889.1）、家鼠（XM_006534874.2）、羊（XM_012180242.1）、鸡（XM_001233720.3）PAQR3氨基酸序列的一致性在81%以上,其中与猕猴的亲缘关系最近,与牛的亲缘关系相对较远。PAQR3蛋白氨基酸序列包含保守的Hly IⅡ结构域,为亲水性蛋白,有7个跨膜螺旋结构;其二级结构主要是延伸链,占31.83%;该蛋白不存在信号肽,不属于分泌蛋白。q RT-PCR分析结果表明,PAQR3基因在广西巴马小型猪的不同组织中均有表达,以在肺脏中的表达量最高、脂肪中的表达量最低;经高脂高糖诱导后,PAQR3基因在广西巴马小型猪肝脏组织中的表达水平显著降低（P〈0.05）。【结论】PAQR3基因在广西巴马小型猪不同组织中广泛表达,在胆固醇和甘油三脂充裕的条件下,机体可通过下调PAQR3基因的表达量来平衡胆固醇含量。 |
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| AbstractList | 【目的】克隆广西巴马小型猪孕激素和脂联素分子受体3（PAQR3）基因,并研究该基因在广西巴马小型猪不同组织中的表达特性,为揭示PAQR3的功能及其在疾病模型中的作用打下基础。【方法】采用RT-PCR扩增广西巴马小型猪PAQR3基因,应用在线预测软件对其功能和结构进行生物信息学分析,并以q RT-PCR分析PAQR3基因在不同组织中的表达特性及高脂高糖诱导后的表达水平。【结果】广西巴马小型猪PAQR3基因编码区（CDS）序列全长936 bp,编码312个氨基酸,与人类（XM_006714106.2）、猕猴（NM_001257693.1）、牛（XM_010806259.1）、家犬（XM_014109889.1）、家鼠（XM_006534874.2）、羊（XM_012180242.1）、鸡（XM_001233720.3）PAQR3氨基酸序列的一致性在81%以上,其中与猕猴的亲缘关系最近,与牛的亲缘关系相对较远。PAQR3蛋白氨基酸序列包含保守的Hly IⅡ结构域,为亲水性蛋白,有7个跨膜螺旋结构;其二级结构主要是延伸链,占31.83%;该蛋白不存在信号肽,不属于分泌蛋白。q RT-PCR分析结果表明,PAQR3基因在广西巴马小型猪的不同组织中均有表达,以在肺脏中的表达量最高、脂肪中的表达量最低;经高脂高糖诱导后,PAQR3基因在广西巴马小型猪肝脏组织中的表达水平显著降低（P〈0.05）。【结论】PAQR3基因在广西巴马小型猪不同组织中广泛表达,在胆固醇和甘油三脂充裕的条件下,机体可通过下调PAQR3基因的表达量来平衡胆固醇含量。 S828.89; [目的]克隆广西巴马小型猪孕激素和脂联素分子受体3(PAQR3)基因,并研究该基因在广西巴马小型猪不同组织中的表达特性,为揭示PAQR3的功能及其在疾病模型中的作用打下基础.[方法]采用RT-PCR扩增广西巴马小型猪PAQR3基因,应用在线预测软件对其功能和结构进行生物信息学分析,并以qRT-PCR分析PA QR3基因在不同组织中的表达特性及高脂高糖诱导后的表达水平.[结果]广西巴马小型猪PAQR基因编码区(CDS)序列全长936bp,编码3l2个氨基酸,与人类(XM 0067141062)、猕猴(NM 001257693.1)、牛(XM 010806259.1)、家犬(XM 014109889.1)、家鼠(XM 006534874.2)、羊(XM_012180242.1)、鸡(XM_001233720.3) PAQR3氨基酸序列的一致性在81％以上,其中与猕猴的亲缘关系最近,与牛的亲缘关系相对较远.PAQR3蛋白氨基酸序列包含保守的HlyI Ⅱ结构域,为亲水性蛋白,有7个跨膜螺旋结构;其二级结构主要是延伸链,占31.83％;该蛋白不存在信号肽,不属于分泌蛋白.qRT-PCR分析结果表明,PA QR3基因在广西巴马小型猪的不同组织中均有表达,以在肺脏中的表达量最高、脂肪中的表达量最低;经高脂高糖诱导后,PAQR3基因在广西巴马小型猪肝脏组织中的表达水平显著降低(P＜0.05).[结论]PAQR3基因在广西巴马小型猪不同组织中广泛表达,在胆固醇和甘油三脂充裕的条件下,机体可通过下调PAQR3基因的表达量来平衡胆固醇含量. |
| Author | 司景磊 黄玥萌 李龙 陈秋明 严雪瑜 吴延军 张笠 蒋钦杨 兰干球 郭亚芬 |
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| Keywords | 克隆 expression patterns analysis 表达谱分析 PAQR3基因 PAQR3 gene Guangxi Bama mini-pig 广西巴马小型猪 cloning |
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| Notes | 45-1381/S SI Jing-lei, HUANG Yue-meng, LI Long, CHEN Qiu-ming, YAN Xue-yu, WU Yan-jun, ZHANG Li, JIANG Qin-yang, LAN Gan-qiu, GUO Ya-fen （College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning 530005, China） Guangxi Bama mini-pig; PAQR3 gene ; cloning; expression patterns analysis [Objective]The present experiment was conducted to clone progesterone and adipoQ receptor 3 （PAQR3） gene of Guangxi Bama mini-pig and investigate its expresssion in different tissues of Guangxi Bama mini-pig, in order to lay a foundation for revealing PAQR3 fuction and its role in disease models. [Method]The PAQR3 gene of Guangxi Bama mini-pig was cloned by RT-PCR, the protein structure of porcine PAQR3 was analyzed based on bioinformatics using on- line prediction software. The PAQR3 gene expression pattern in different tissues and its expression level after being in- duced by high fat and high sugar were detected by qRT-PCR. [Result]The results showed that, the PAQR3 gene of Guangxi Bama mini-pig was 936 bp in length, |
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