广西巴马小型猪SLA-DQB基因的克隆及序列分析

利用RT-PCR的方法从广西巴马小型猪肝脏组织中扩增SLA-DQB基因的编码区序列,旨在为下一步构建SLA-DQB转基因广西巴马小型猪奠定基础.结果表明,克隆的广西巴马小型猪SLA-DQB基因编码区长687 bp,与GenBank参考序列（NM_001113694）相比,共有15个氨基酸发生突变（位点为10、14、19、27、29、38、39、48、58、61、68、72、76、78、183）.与普通猪、其他小型猪、奶牛、人类及小鼠的同源性分别为95.8％、95.8％、88.1％、86.2％和80.0％....

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Published in广东农业科学 Vol. 41; no. 5; pp. 187 - 189
Main Author 霍秋红 杨秀荣 黄光成 黄化平 顾浩 兰干球 蒋和生 蒋钦杨 郭亚芬
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 广西大学动物科学技术学院,广西南宁,530004 2014
Subjects
SLA-DQB
免疫排斥
广西巴马小型猪
异种器官移植
异种器官移植
广西巴马小型猪
免疫排斥
SLA-DQB
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ISSN1004-874X

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Summary:利用RT-PCR的方法从广西巴马小型猪肝脏组织中扩增SLA-DQB基因的编码区序列,旨在为下一步构建SLA-DQB转基因广西巴马小型猪奠定基础.结果表明,克隆的广西巴马小型猪SLA-DQB基因编码区长687 bp,与GenBank参考序列（NM_001113694）相比,共有15个氨基酸发生突变（位点为10、14、19、27、29、38、39、48、58、61、68、72、76、78、183）.与普通猪、其他小型猪、奶牛、人类及小鼠的同源性分别为95.8％、95.8％、88.1％、86.2％和80.0％.
Bibliography:44-1267/S
HUO Qiu-hong YANG Xiu-rong HUANG Guang-cheng HUANG Hua-ping GU Hao LAN Gan-qiu JIANG He-sheng （College of Animal Science and Technology, Guangxi University, Nanning 530004, China）
Reverse transcription （RT） PCR was used to amplify the coding sequence of SLA-DQB in liver from Guangxi Bama mini-pig in order to prepare for SLA-DQB transgenic Guangxi Bama mini-pig. The result showed that the length of SLA-DQB was 687 bp. 15 missense mutations （Site 10, 14, 19, 27, 29, 38, 39, 48, 58, 61, 68, 72, 76, 78, 183） were found and led to the change of amino acid in SLA-DQB in Guangxi Bama mini-pig compared with reference sequence （NM_001113694）. Homological analysis showed that there were 95.8%, 95.8%, 88.1%, 86.2%, 80.0% compared with Sus scrofa, miniature swine, Bos taurus, Homo sapiens, and Mus musculus, respectively.
Guangxi Bama mini-pig; SLA-DQB; xenotransplantation; immune rejection
ISSN:1004-874X