拟南芥染色质重塑因子AtBRM和AtSWI3C基因的克隆及生物信息学分析

非生物逆境如盐渍、干旱等严重影响植物的生长发育,越来越多的证据表明染色质重塑参与植物响应逆境胁迫,并在该过程中起到重要作用。研究逆境胁迫下植物体内的染色质重塑因子基因表达及信号传导网络调控机制对于阐明植物的逆境响应反应及培育耐逆性作物具有重要的理论和现实意义。对拟南芥SWI/SNF染色质重塑复合体亚基AtBRAHMA（AtBRM）和AtSWI3C进行初步研究发现,AtBRM和AtSWI3C均含有核定位信号,AtBRM蛋白具有SNF2_N结构域,为ATPase亚基;同时,AtBRM还含有维持蛋白与组蛋白相互作用的BROMO结构域和维持蛋白蛋白间作用的QLQ结构域,而AtSWI3C则含有与DNAb...

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Published in广东农业科学 Vol. 39; no. 14; pp. 131 - 135
Main Author 高燕 杨松光 崔玉海 吴克强
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 中国科学院研究生院,北京100049%中国科学院华南植物园/中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室,广东广州,510650%加拿大农业与食品部南方作物保护与食品研究中心,安大略伦敦N5V 4T3 2012
中国科学院华南植物园/中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室,广东广州510650
Subjects
染色质重塑
生物信息学分析
非生物逆境
生物信息学分析
非生物逆境
染色质重塑
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ISSN1004-874X
DOI10.3969/j.issn.1004-874X.2012.14.041

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Summary:非生物逆境如盐渍、干旱等严重影响植物的生长发育,越来越多的证据表明染色质重塑参与植物响应逆境胁迫,并在该过程中起到重要作用。研究逆境胁迫下植物体内的染色质重塑因子基因表达及信号传导网络调控机制对于阐明植物的逆境响应反应及培育耐逆性作物具有重要的理论和现实意义。对拟南芥SWI/SNF染色质重塑复合体亚基AtBRAHMA（AtBRM）和AtSWI3C进行初步研究发现,AtBRM和AtSWI3C均含有核定位信号,AtBRM蛋白具有SNF2_N结构域,为ATPase亚基;同时,AtBRM还含有维持蛋白与组蛋白相互作用的BROMO结构域和维持蛋白蛋白间作用的QLQ结构域,而AtSWI3C则含有与DNAbinding的相关结构域;二者的启动子区域均包含与ABA调控和非生物逆境胁迫相关的顺式作用元件。
Bibliography:44-1267/S
abiotic stress; chromatin remodeling; bioinformatic analysis
GAO Yan,YANG Song-guang,CUI Yu-hai,WU Ke-qiang（1.South China Botanical Garden/Key Laboratory of Plant Resources Conservation and Sustainable Utilization,Chinese Academy of Sciences,Guangzhou 510650,China;2.Graduate School of Chinese Academy of Sciences,Beijing 100049,China; 3.Agriculture and Agri-Food Canada,Southern Crop Protection and Food Research Centre,London N5V 4T3,Canada）
Environmental stresses,such as high salinity,drought and cold affect plant growth.Recent studies have indicated that chromatin remodeling is involved in the regulation of gene expression in plant stress responses.Identifying the key chromatin remodeling factors and signaling networks are indispensable for understanding the transcriptional regulatory network of the stress responses.AtBRAHMA（AtBRM）and AtSWI3C are two subunits of the SWI/SNF chromatin remodeling complex.It was found that both AtBRM and AtSWI3C in Arabidopsis thaliana have nuclear localization signal（NLS
ISSN:1004-874X
DOI:10.3969/j.issn.1004-874X.2012.14.041