斑节对虾GRP94基因的克隆及其在不同应激条件下的表达与分析

以斑节对虾（Penaeus monodon）为研究对象,利用RACE技术克隆得到了斑节对虾Pm GRP94基因c DNA全长,并对其结构进行生物信息学分析。Pm GRP94全长2 990 bp,包括75 bp的5＇UTR、527 bp的3＇UTR和2 388bp的ORF。利用实时定量PCR技术,对Pm GRP94组织特异性及其在不同p H、盐度和3种重金属应激下转录水平变化情况及特点进行了研究。结果显示,Pm GRP94基因存在组织特异性,并在肝胰腺中的表达量最高;不同的应激条件下其表达具有明显差异,其中在p H、铜（Cu）和锌（Zn）的应激下Pm GRP94的表达显著升高。因此预测该基因可以...

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Published in南方水产科学 Vol. 12; no. 5; pp. 61 - 70
Main Author 史进选 傅明骏 赵超 周发林 杨其彬 邱丽华
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 中国水产科学研究院南海水产研究所,农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东广州510300 2016
上海海洋大学水产与生命学院,上海201306%中国水产科学研究院南海水产研究所,农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东广州510300%中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心,海南三亚,572018
Subjects
GRP94
pH
基因克隆
基因表达
斑节对虾
盐度
重金属
gene clone
salinity
斑节对虾
pH
盐度
gene pression
基因表达
heavy metal
Penaeus monodon
GRP94
基因克隆
重金属
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ISSN2095-0780
DOI10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.008

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Summary:以斑节对虾（Penaeus monodon）为研究对象,利用RACE技术克隆得到了斑节对虾Pm GRP94基因c DNA全长,并对其结构进行生物信息学分析。Pm GRP94全长2 990 bp,包括75 bp的5＇UTR、527 bp的3＇UTR和2 388bp的ORF。利用实时定量PCR技术,对Pm GRP94组织特异性及其在不同p H、盐度和3种重金属应激下转录水平变化情况及特点进行了研究。结果显示,Pm GRP94基因存在组织特异性,并在肝胰腺中的表达量最高;不同的应激条件下其表达具有明显差异,其中在p H、铜（Cu）和锌（Zn）的应激下Pm GRP94的表达显著升高。因此预测该基因可以作为斑节对虾受p H、Cu和Zn胁迫的指示基因。
Bibliography:In the present study,the full-length of Pm GRP94 was cloned from Penaeus monodon using RACE-PCR. The full-length of Pm GRP94 c DNA was 2 990 bp containing a 5＇ untranslated region（ UTR） of 75 bp,a 3＇ UTR of 527 bp and an open reading frame（ ORF） of 2 388 bp. We analyzed the characterization and expression,of tissue specificity of Pm GRP94 when the shrimps were exposed with different p H values,salinities and three heavy metals using real time PCR（ RT-PCR）. The highest expression level was found in hepatopancreas. The transcription levels of Pm GRP94 were significantly up-regulated under p H,copper and znic challenges.The results suggest that Pm GRP94 might be a promising candidate marker for p H stress, cadmium and manganese exposure in shrimps.
SHI Jinxuan1,2, FU Mingjun1, ZHAO Chao1, ZHOU Falin1, YANG Qibin3, QIU Lihua1 （1. Key Lab. of South China Sea Fishery Resources Exploitation ＆ Utilization, Ministry of Agriculture; South China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guang
ISSN:2095-0780
DOI:10.3969/j.issn.2095-0780.2016.05.008