環境傾度によるダイズ根粒菌の群集生態に関する研究
ダイズ根粒菌にはBradyrhizobium 属のB. japonicum, B. elkanii, B. diazoefficiens，およびSinorhizobium（Ensifer）属のS. fredii が主なダイズ根粒菌として知られている。これらの根粒菌は環境に応じてその根粒占有率や土壌での優占化の度合いを異にしている。本シンポジウムでは16S–23S rRNA 遺伝子ITS領域の解析を基にした根粒菌群集構造について，緯度，土壌pH，塩類集積，酸化還元の環境因子の傾度による違いを纏めてみた。日本は南北に長い国土を有し，北から南へダイズ根粒菌群集の遷移が認められる。さらに，水田転換畑で...
Saved in:
| Published in | 土と微生物 Vol. 76; no. 2; pp. 43 - 48 |
|---|---|
| Main Author | |
| Format | Journal Article |
| Language | Japanese |
| Published |
日本土壌微生物学会
2022
|
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 0912-2184 2189-6518 |
| DOI | 10.18946/jssm.76.2_43 |
Cover
| Abstract | ダイズ根粒菌にはBradyrhizobium 属のB. japonicum, B. elkanii, B. diazoefficiens，およびSinorhizobium（Ensifer）属のS. fredii が主なダイズ根粒菌として知られている。これらの根粒菌は環境に応じてその根粒占有率や土壌での優占化の度合いを異にしている。本シンポジウムでは16S–23S rRNA 遺伝子ITS領域の解析を基にした根粒菌群集構造について，緯度，土壌pH，塩類集積，酸化還元の環境因子の傾度による違いを纏めてみた。日本は南北に長い国土を有し，北から南へダイズ根粒菌群集の遷移が認められる。さらに，水田転換畑でB. diazoefficiensの高い根粒占有率が観察される。また，アルカリ性の塩類化土壌でS. fredii の高い根粒占有率が観察される。これらの現象は研究室レベルでの再現が可能であった。ダイズ根粒菌に関しては，環境因子の変動に応じた根粒占有率の変化や土壌での優占化が観察され，環境因子と根粒菌群集構造に密接な関連が認められる。近年，次世代シークエンサーによる群集解析が容易になり，特異的プライマーをデザインすることにより，土壌中のBradyrhizobium 属ダイズ根粒の群集構造解析が可能になってきた。さらなる根粒菌生態のデータ蓄積により，根粒菌群集構造のコントロールとダイズ生産性の向上を目標に研究の展開が期待される。 |
|---|---|
| AbstractList | ダイズ根粒菌にはBradyrhizobium 属のB. japonicum, B. elkanii, B. diazoefficiens，およびSinorhizobium（Ensifer）属のS. fredii が主なダイズ根粒菌として知られている。これらの根粒菌は環境に応じてその根粒占有率や土壌での優占化の度合いを異にしている。本シンポジウムでは16S–23S rRNA 遺伝子ITS領域の解析を基にした根粒菌群集構造について，緯度，土壌pH，塩類集積，酸化還元の環境因子の傾度による違いを纏めてみた。日本は南北に長い国土を有し，北から南へダイズ根粒菌群集の遷移が認められる。さらに，水田転換畑でB. diazoefficiensの高い根粒占有率が観察される。また，アルカリ性の塩類化土壌でS. fredii の高い根粒占有率が観察される。これらの現象は研究室レベルでの再現が可能であった。ダイズ根粒菌に関しては，環境因子の変動に応じた根粒占有率の変化や土壌での優占化が観察され，環境因子と根粒菌群集構造に密接な関連が認められる。近年，次世代シークエンサーによる群集解析が容易になり，特異的プライマーをデザインすることにより，土壌中のBradyrhizobium 属ダイズ根粒の群集構造解析が可能になってきた。さらなる根粒菌生態のデータ蓄積により，根粒菌群集構造のコントロールとダイズ生産性の向上を目標に研究の展開が期待される。 ダイズ根粒菌にはBradyrhizobium属のB. japonicum，B. elkanii，B. diazoefficiens，およびSinorhizobium(Ensifer）属のS. frediiが主なダイズ根粒菌として知られている。これらの根粒菌は環境に応じてその根粒占有率や土壌での優占化の度合いを異にしている。本シンポジウムでは16S-23S rRNA遺伝子ITS領域の解析を基にした根粒菌群集構造について，緯度，土壌pH，塩類集積，酸化還元の環境因子の傾度による違いを纏めてみた。日本は南北に長い国土を有し，北から南へダイズ根粒菌群集の遷移が認められる。さらに，水田転換畑でB. diazoefficiensの高い根粒占有率が観察される。また，アルカリ性の塩類化土壌でS. frediiの高い根粒占有率が観察される。これらの現象は研究室レベルでの再現が可能であった。ダイズ根粒菌に関しては，環境因子の変動に応じた根粒占有率の変化や土壌での優占化が観察され，環境因子と根粒菌群集構造に密接な関連が認められる。近年，次世代シークエンサーによる群集解析が容易になり，特異的プライマーをデザインすることにより，土壌中のBradyrhizobium属ダイズ根粒の群集構造解析が可能になってきた。さらなる根粒菌生態のデータ蓄積により，根粒菌群集構造のコントロールとダイズ生産性の向上を目標に研究の展開が期待される。 |
| Author | 佐伯, 雄一 |
| Author_xml | – sequence: 1 fullname: 佐伯, 雄一 organization: 宮崎大学 |
| BackLink | https://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/2010946350$$DView record in AgriKnowledge |
| BookMark | eNo9kE1LAlEUhi9hkJnLfsbYnXuvd-4sWoRUBkKbWl_OfNlMfjEjRLscKQKDQCSIFolIEEFEiyAX_pmLTv6LRow258DzPu9ZnE2UaTQbLkLbOi7owmR8J4iiesHgBSIZXUNZklKNF3WRQVls6kRLAdtA-SjyLYwJIbqJcRaVk_7HbNSdxdPZ5EV13lR8q-Ke6l6peKziyXz4nXz2f-7vVOc9mY4XTzfJ4Hl-3UvNxcNIdR5TORkOktevLbTuQS1y8387h04P9k9KZa1yfHhU2qtoQEgRNAaEEo8Zjmk6jHic6o5HbYMKz00jMGzgnFjcEcSiDIQhLEwJ2MQRtrAcBjSHjNVd8LzQb0uohv55o3lRc52qK5vgy2Vgy2pTBi2JdYmxyakommlzd9UMojakbiv06xBeSgjbvl1z5fKB0uCSLAej_9w-g1AGQH8BVriGtg |
| ContentType | Journal Article |
| Copyright | 2022 学協会著作権協議会（学著協） |
| Copyright_xml | – notice: 2022 学協会著作権協議会（学著協） |
| DBID | N5S |
| DOI | 10.18946/jssm.76.2_43 |
| DatabaseName | AgriKnowledge（アグリナレッジ）AGROLib |
| DatabaseTitleList | |
| DeliveryMethod | fulltext_linktorsrc |
| EISSN | 2189-6518 |
| EndPage | 48 |
| ExternalDocumentID | oai_affrc_go_jp_01_00963859 article_jssm_76_2_76_43_article_char_ja |
| GroupedDBID | ALMA_UNASSIGNED_HOLDINGS M~E N5S |
| ID | FETCH-LOGICAL-a225a-4a232f47d99d42f631df3c738fe4a2a7ca662b6d82b34a878b032ac2d8c8bd4a3 |
| ISSN | 0912-2184 |
| IngestDate | Sat Oct 18 14:32:55 EDT 2025 Wed Apr 05 11:38:13 EDT 2023 |
| IsDoiOpenAccess | true |
| IsOpenAccess | true |
| IsPeerReviewed | true |
| IsScholarly | true |
| Issue | 2 |
| Language | Japanese |
| LinkModel | OpenURL |
| MergedId | FETCHMERGED-LOGICAL-a225a-4a232f47d99d42f631df3c738fe4a2a7ca662b6d82b34a878b032ac2d8c8bd4a3 |
| Notes | ZZ00016779 946350 |
| OpenAccessLink | https://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/2010946350 |
| PageCount | 6 |
| ParticipantIDs | affrit_agriknowledge_oai_affrc_go_jp_01_00963859 jstage_primary_article_jssm_76_2_76_43_article_char_ja |
| PublicationCentury | 2000 |
| PublicationDate | 2022 |
| PublicationDateYYYYMMDD | 2022-01-01 |
| PublicationDate_xml | – year: 2022 text: 2022 |
| PublicationDecade | 2020 |
| PublicationTitle | 土と微生物 |
| PublicationTitleAlternate | 土と微生物 |
| PublicationYear | 2022 |
| Publisher | 日本土壌微生物学会 |
| Publisher_xml | – name: 日本土壌微生物学会 |
| SSID | ssib002221900 ssib023160297 ssib044763415 ssib004380821 |
| Score | 2.2910316 |
| Snippet | ダイズ根粒菌にはBradyrhizobium 属のB. japonicum, B. elkanii, B. diazoefficiens，およびSinorhizobium（Ensifer）属のS. fredii が主なダイズ根粒菌として... ダイズ根粒菌にはBradyrhizobium属のB. japonicum，B. elkanii，B. diazoefficiens，およびSinorhizobium(Ensifer）属のS. frediiが主なダイズ根粒菌として... |
| SourceID | affrit jstage |
| SourceType | Open Access Repository Publisher |
| StartPage | 43 |
| Title | 環境傾度によるダイズ根粒菌の群集生態に関する研究 |
| URI | https://www.jstage.jst.go.jp/article/jssm/76/2/76_43/_article/-char/ja https://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/2010946350 |
| Volume | 76 |
| hasFullText | 1 |
| inHoldings | 1 |
| isFullTextHit | |
| isPrint | |
| ispartofPNX | 土と微生物, 2022, Vol.76(2), pp.43-48 |
| journalDatabaseRights | – providerCode: PRVHPJ databaseName: ROAD: Directory of Open Access Scholarly Resources customDbUrl: eissn: 2189-6518 dateEnd: 99991231 omitProxy: true ssIdentifier: ssib044763415 issn: 0912-2184 databaseCode: M~E dateStart: 20160101 isFulltext: true titleUrlDefault: https://road.issn.org providerName: ISSN International Centre |
| link | http://utb.summon.serialssolutions.com/2.0.0/link/0/eLvHCXMwnR1NaxUxcKn14kUUFesXPZjj1n1JNpscd5_7KIKeWugtZL-KD2xL-3rpQewrilBBKEUQD5ZSBBFEPAhW6J9Z2mf_hTOb3bpQEeslzJtNMpPMvMxMSCaOcxdsTs6LjnCl6OQurJKpqyDOcE3OM_BGVCpTvDv88JGYnuUP5vy5sbEfrVNLq4NkKl37472S_5Eq4ECueEv2DJI96RQQAIN8oQQJQ_lPMiZxQBQlkUdin4SUSIaABEyMQBSSUJCYgbdIwqgCoI5sAItheNbBYkJeA9AwFiT0SKSQRESRSiyJ7BHZbTqMq09x1UoRFREpKn44UT1sLv2GhKUOdQQyaTFKtdgIkBY0RECRSLQ9ZhyI6lZ92q5kNbS4ZqAmFxCpoG2jPiTmJLpPlFcBXRL2UJUaPnmFheF47T0P2t4AVR3qYljaXsHtCzK1ptLWcmwzQNWG3Wb0PGUypKqSJfdXVp5MBWKK6qbR6SzcRbGc6vlF3V_SXkdj9Mekr8455yluBuG50adxyzcCY9DKfYip_VuXksGvFvhwWPObc1jpuX1xoxljnRMWObzX5g-8JeTlMcZCfQgimgOIlU80c8m5WAczk6HVzMvOWN9ccaZHW18OdzcOhweH-x_K9U_l8GU53Cw3npXDvXK4f7TzffR16-frV-X659HB3vG7F6Pt90fPN6Hm8Zvdcv0tVB7tbI8-frvqzPbime60W7_X4RqwCsblBtzzggeZUhmnhWCdrGBpwGSRwycTpEYImohM0oRxIwOZeIyalGYylUnGDbvmjC8sLuTXncmAMZplwofQz_DUNypIwBDRLKcs9Tt5MuF4dga0mV_-vf2s_yKmCUfYudJLNo-Lrv-3GqdWB0JTLDg7weO9R903N85O66ZzAdXWbtXdcsYHy6v5bXBeB8mdSkl-AT7ziFA |
| linkProvider | ISSN International Centre |
| openUrl | ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info%3Aofi%2Fenc%3AUTF-8&rfr_id=info%3Asid%2Fsummon.serialssolutions.com&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=%E7%92%B0%E5%A2%83%E5%82%BE%E5%BA%A6%E3%81%AB%E3%82%88%E3%82%8B%E3%83%80%E3%82%A4%E3%82%BA%E6%A0%B9%E7%B2%92%E8%8F%8C%E3%81%AE%E7%BE%A4%E9%9B%86%E7%94%9F%E6%85%8B%E3%81%AB%E9%96%A2%E3%81%99%E3%82%8B%E7%A0%94%E7%A9%B6&rft.jtitle=%E5%9C%9F%E3%81%A8%E5%BE%AE%E7%94%9F%E7%89%A9&rft.au=%E4%BD%90%E4%BC%AF%2C+%E9%9B%84%E4%B8%80&rft.date=2022&rft.issn=0912-2184&rft.volume=76&rft.issue=2&rft.spage=43&rft.epage=48&rft_id=info:doi/10.18946%2Fjssm.76.2_43&rft.externalDocID=oai_affrc_go_jp_01_00963859 |
| thumbnail_l | http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/lc.gif&issn=0912-2184&client=summon |
| thumbnail_m | http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/mc.gif&issn=0912-2184&client=summon |
| thumbnail_s | http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/sc.gif&issn=0912-2184&client=summon |